Attacken är den senaste i raden av dödliga dåd och innebär att tre FN-soldater har dödats i Mali på lika många dagar.
Dessutom har sex civila dödats när deras vagn körde på en sprängladdning, enligt källor från militären och myndigheterna.
Jihadistgrupper tros ligga bakom attackerna mot FN-soldaterna, Malis militär, samt civila och i ett uttalande uppmanar FN:s säkerhetsråd Malis myndigheter att skyndsamt "utreda attacken mot fredsbevarande styrkor och ställa förövarna inför rätta”.
FN har runt 13 000 soldater i Mali genom insatsen Minusma. Den fredsbevarande styrkan är en av FN:s största och anses vara en av de farligaste. Hittills har 174 FN-soldater dödats i attacker sedan Minsuma bildades 2013.