"Frankrike är djupt oroat över informationen om massövergrepp i byn Moura, utfört av delar av Malis beväpnade styrkor tillsammans med ryska legosoldater från Wagnergruppen, som sägs ligga bakom hundratals civila dödsfall", skriver franska utrikesdepartementet.
Enligt Malis armé har över 200 personer "oskadliggjorts" i byn Moura i förra veckan efter en räd mot vad armén kallar för terroristterritorium.
Beskedet kom samtidigt som vittnesmål från byn uppgav att flera civila dödats av de maliska och ryska styrkorna. Operationen mot byn, som ligger i centrala Mali, ska ha pågått i sex dagar.
"Kampen mot terrorgrupper som verkar i Sahel kan inte på något sätt rättfärdiga brott mot mänskliga rättigheter", skriver det franska departementet, och påpekar att våld riktat mot civila enbart kommer att stärka terrorgruppernas inflytande.
Även EU har uttryckt oro över rapporter om att en massaker ägt rum i Moura.
Frankrike riktar sig i uttalandet till offrens familj för att beklaga sorgen och begär att händelserna ska undersökas nationellt och internationellt.