Vuxna tillåts att ha upp till sju gram cannabis och att odla upp till fyra plantor hemma, enligt den nya lagen som stöds av regeringspartiet Labour.
Det blir också tillåtet att bilda föreningar för att odla och använda cannabis. Föreningarna får som mest ha 500 medlemmar.
– Vi avråder människor från att röka cannabis samtidigt som vi inte behandlar dem som väljer att göra det som brottslingar. Narkotikasmuggling kommer fortsätta att vara olagligt, sade premiärminister Robert Abela under en debatt i parlamentet i förra månaden.
Han sade vidare att landet ska ha en fortsatt hård hållning mot langare.
Det kommer fortfarande vara förbjudet att använda cannabis offentligt.
Det konservativa Nationalistpartiet motsatte sig. Partiet har varnat för att en legalisering "skulle normalisera och öka narkotikaanvändningen i vårt land".
Flera länder i Europa är på väg att legalisera cannabis för eget bruk, bland annat Luxemburg.
Även i Tyskland finns planer på att legalisera drogen och behandla cannabis ungefär som alkohol.