Vid den mångåriga människorättsorganisationen al-Haqs kontor var dörren under morgonen förseglad och försedd med ett meddelande om att den kommer att fortsätta hållas stängd av säkerhetsskäl.
al-Haqs chef Shawan Jabarin säger att soldaterna "kom, sprängde dörren, och höll på med dokumenten". Han berättar vidare att personalen fortfarande undersöker om soldaterna tog med sig dokument när de lämnade.
Timmar efter tillslaget mot al-Haq besökte Sven Kühn von Burgsdorff, EU:s representant till de palestinska områdena, organisationens kontor för att visa sitt stöd.
– Vi ger uttryck för vår solidaritet med våra partner, som vi har stöttat i många, många år, säger Kühn von Burgsdorff.
Amerikanska utrikesdepartementets talesperson Ned Price säger att räderna och nedstängningarna "bekymrar" USA, och lägger till att civilsamhället är en "viktig del av blomstrande demokratier".
al-Haq är en av sex palestinska grupper som i oktober stämplades som terrororganisationer av Israel med hänvisning till påstådda kopplingar till den militanta vänsterrörelsen Folkfronten för Palestinas befrielse (PFLP).
Inga bevis har offentliggjorts för anklagelserna, enligt AFP. I juli meddelade flera EU-länder, däribland Sverige, att de fortsätter att samarbeta med de sex grupperna då man inte fått någon tydlig motivering av terrorstämpeln.