Enligt palestinska medier som pratat med vittnen ska israeliska soldater ha öppnat eld mot en bil i staden Jenin. I videoklipp som sprids på nätet hörs intensiv skottlossning från området.
Den israeliska militären låter meddela att insatsen genomfördes för att lokalisera vapen. Enligt den israeliska sidan började palestinier skjuta mot soldaterna och kasta något slags bomber mot dem, varpå soldaterna sköt tillbaka.
Hamas vill hämnas
"I tillägg sköt väpnade angripare i en bil mot soldaterna, som svarade med skarp eldgivning för att neutralisera angriparna", meddelar den israeliska militären, som lägger upp bilder på automatvapen som sedan ska ha hittats i fordonet.
Det palestinska ledarskapet beskriver det som att de israeliska styrkorna "kallblodigt mördade" tre civila personer, enligt den palestinska nyhetsbyrån Wafa. De tre männen som dödades har identifierats som tre män som var 23 till 24 år gamla.
Utöver det skadades minst tio personer. AFP:s fotograf har sett en vit bil med mängder av skotthål på platsen.
Islamistiska Hamas säger att en av de dödade männen var ett av dess befäl på Västbanken och lovar att utkräva hämnd.
Hundratals personer samlades efter händelsen till en spontan protest utanför ett sjukhus i Jenin.
Våldsamma veckor
Israelisk militär har de senaste månaderna trappat upp sina insatser i Jenin, som utgör ett fäste för flera väpnade islamistgrupper. Våldsamheterna i regionen har också trappats upp de senaste månaderna.
Palestinska gärningspersoner har dödat omkring 20 israeler i olika dåd på israeliskt territorium och i militära räder på Västbanken har ännu fler palestinier dödats, bland dem misstänkta gärningspersoner och personer som deltagit i drabbningar, men också många civila.
Spänningarna tilltog ytterligare när den palestinsk-amerikanska journalisten Shireen Abu Akleh sköts ihjäl den 11 maj. Vittnen och utredningar pekar på att hon dödades av skott från israeliska soldater, men det tillbakavisas av Israel.