Uppgiften om att den islamistiska extremistgruppen har en kommando- och kontrollcentral under sjukhuset beläggs av Vita huset "efter en rad underrättelsemetoder".
– De (Hamas) har lagrat vapen där och de är beredda på att svara på en israelisk militär insats mot byggnaden, säger John Kirby, talesperson för USA:s nationella säkerhetsråd.
Kirby understryker samtidigt att underrättelseuppgifterna inte förändrar USA:s uppfattning att Israel måste vara mer återhållsamt i arméns insatser, och att sjukhus och patienter måste skyddas.
– Vi stödjer inte ett anfall mot sjukhuset från luften.
Hamas förnekar
Israel har tidigare hävdat att extremistgruppen har haft militära anläggningar inom sjukhusområdet.
Hamas har i sin tur konsekvent förnekat att man använt sjukhusområdet för militära ändamål, och internationella påtryckningar mot Israel har uppmanat israelisk militär att inte attackera sjukhuset.
Terrorstämplade Hamas säger att Vita husets utspel ger klartecken till Israel att utföra en "brutal massaker" i sjukhuset al-Shifa.
"USA bär direkt ansvar för att möjliggöra Israels folkmordskrig mot Gaza", skriver Hamas i ett uttalande på engelska, där man hävdar att målet är att målet är att förstöra Gazas sjukvårdssystem.
Rapporterna inifrån al-Shifa-sjukhuset, som är Gazas största, berättar om ett katastrofalt läge. Läkare berättar hur de måste gräva massgravar utanför sjukhusbyggnaderna för begrava dem som dött.
Enligt en läkare har omkring 180 personer, bland dem barn, blivit begravda där. Dessa är personer som har avlidit på sjukhusets intensivvårdsavdelning efter att bränslet som drev sjukhuset tog slut.
– Det finns kroppar utspridda i sjukhusanläggningen och det finns inte längre el på bårhusen, säger sjukhuschefen Mohammad Abu Salmiyah.
Intar fler platser
Israels försvarsminister Yoav Gallant sade på en presskonferens sent på tisdagen att Hamas har "förlorat kontrollen" över norra delen av Gazaremsan.
– Faktum är att vi har kontroll över hela insatsområdet i Gazaremsan, i norra delen av remsan och speciellt i staden Gaza, säger Gallant.
Men Gallant ser inget snart slut på kriget:
– Vi talar om långa månader, inte en dag eller två.
Israeliska medier publicerade bilder på hur en grupp israeliska soldater poserade i parlamentsbyggnaden i Gaza stad.
Den israeliska militären bekräftade att den har tagit kontroll över parlamentsbyggnaden, men också områdets regeringsbyggnad, ett polishögkvarter och en plats som beskrivs som ett slags vapenfabrik.
Det framgår inte om övertagandena av just dessa byggnader på något vis var befästa av Hamas styrkor eller om de föregicks av några större strider.
Svårt i södra Gaza
Ytterligare omkring 200 000 människor har flytt de norra delarna av Gaza söderut under de senaste dagarna, enligt FN:s humanitära organ Ocha.
Men israeliskt stridsflyg genomför kontinuerligt bombräder mot mål som uppges tillhöra Hamas, men varifrån många civila dödsoffer rapporteras.
Läkare utan gränser (MSF) har lyckats få 15 utsända att ta sig över gränsen från Egypten för att stödja främst insatser på södra Gazaremsan.
"Människor med fruktansvärda skador och svåra brännsår översvämmar sjukhusen på grund av de pågående bombningarna", skriver MSF.
FN-organet Unrwa beräknar att sammanlagt omkring 580 000 internflyktingar befinner sig i södra delen Av Gaza. Intensiva regnväder på förvärrade läget i de läger där flyende samlats.