Stölden ägde rum den 5 juni i en privat anläggning i en kommersiell hamn i staden Manzanillo vid landets Stillahavskust. och beskrivs i lokala medier som "århundradets stöld".
Gärningspersonerna ska ha använt sig av kranar och lastbilar för att flytta containrarna efter att ha oskadliggjort vakterna. Stölden tog åtta till tio timmar, säger säkerhetstalespersonen Gustavo Adrian Joya.
– Det här är utan motstycke. Vi har sett sporadiska stölder av containrar förut, men inte i en sådan kvantitet.
– De var väldigt selektiva när det gäller typen av varor de stal: ädla metaller och annat, säger han.