Åtgärden träder i kraft de närmaste dagarna, skriver bolaget i en blogg.
Politiker och folkhälsogrupper har uppmanat Facebook att slå ner på innehåll som är missledande om vaccin.
Nu anser Facebook att även om att vaccin mot virussjukdomen covid-19 ännu inte är tillgängligt, har pandemin understrukit vikten av förebyggande hälsobeteende.
Tidigare har Facebook accepterat annonser mot vaccin så länge de inte innehöll felaktiga påståenden.