Vulkanen, som ligger nära staden Yogyakarta på ön Java, har haft flera mindre utbrott de senaste dagarna vilket även orsakat smärre jordskalv, uppger Indonesiens geologiska myndighet. Men på fredagen syntes sju lavaströmmar som rann upp till 700 meter sydväst om berget.
Boende i närheten har ombetts hålla sig utanför en femkilometersradie, mätt från kraterns mitt. Myndigheternas vulkanvarning för Mount Merapi ligger dock kvar på samma nivå, den näst högsta.
Vulkanens senaste stora utbrott skedde 2010. Det tog över 300 människors liv och tvingade 280 000 att lämna sina hem.