Minst 20 människor har dött och flera saknas efter ovädret, som beskrivs som det kraftigaste i världen i år.
Under måndagen inspekterade president Rodrigo Duterte de värst drabbade områdena sydöst om huvudstaden Manila, där upp emot en miljon människor evakuerats till tillfälliga center.
– Tack vare att människor tvångsevakuerades har antalet dödsfall minimerats, sade Dutertes talesperson Harry Roque under en presskonferens.
Supertyfonen har lämnat stor förödelse efter sig, rivit ner kraftledningar och översvämmat stora områden. I Guinobatan i provinsen Albay har runt 300 hus begravts under lera och stenar från vulkanen Mayon. Samtidigt växer oron för att massevakueringarna ska leda till ökad smittspridning av covid-19.
Goni är det artonde tropiska ovädret som rammar Filippinerna i år. I förra veckan dog 22 människor i spåren av tyfonen Molave.