Det är första gången på tre årtionden som ett fall av polio konstaterats i landet.
Utbrottet i Malawi kunde i sin tur kopplas till Pakistan, enligt Världshälsoorganisationen (WHO).
– Att upptäcka ännu ett fall av vilt poliovirus i Afrika är mycket oroande, även om det inte är förvånande med tanke på utbrottet i Malawi, säger WHO:s Afrikachef Matshidiso Moeti.
WHO meddelade i februari att man skulle vidta brådskande åtgärder för att förhindra potentiell spridning.
Polio har legat bakom otaliga fall av död, förlamning och livslånga funktionsnedsättningar, framför allt i fattigare länder. Men tack vare omfattande vaccinationsprogram sprids viruset i dag endast endemiskt i Afghanistan och Pakistan.