Oleg Khorzhan var ledare för det kommunistiska partiet i Transnistrien.
Moldaviens byrå för återintegrering fördömer starkt "kriminella handlingar som hotar människors liv" och har framfört sina kondoleanser till politikerns familj.
Organisationen Promo-lex, som verkar för att skydda mänskliga rättigheter i regionen, säger att Khorzhan var "en av få offentliga personer som hade modet att kämpa för grundläggande rättigheter och friheter" i Transnistrien.
Organisationen uppmanar också utländska diplomatiska beskickningar i landet att övervaka och fördöma "den systemiska förföljelsen av aktivister" i Transnistrien.
Khorzhan dömdes 2018 till drygt fyra års fängelse sedan han anklagats för att ha misshandlat en polis i huvudorten Tiraspol några dagar efter att han ordnat en protest i staden.
Hans parti kallade domen för "absurd" och anklagade Tiraspols myndigheter för politisk förföljelse.
Sedan Ryssland inledde sitt anfallskrig mot Ukraina har Moldaviens ledare upprepade gånger anklagat Ryssland för att försöka destabilisera landet som var en sovjetrepublik fram till 1991.