De begångna dåden kan enligt utredarna röra sig om brott mot mänskligheten och krigsbrott.
Den 1 februari förra året genomfördes statskuppen i Myanmar.
"Tragiskt nog så visar rapporter som kommit in det gångna året att mer än tusen människor dödats i krigsbrott och brott mot mänskligheten under det år som gått sedan militärkuppen", säger FN:s särskilde Myanmarutredare Nicholas Koumjian, i ett uttalande inför årsdagen.
Efter att militären den 1 februari tagit makten från den folkvalda ledaren Aung San Suu Kyi, som nu sitter i fängelse, har demonstrationer och oppositionsyttringar slagits ned hårt.
Sedan militärkuppen har, enligt en lokal organisation som övervakar situationen i landet, fler än 1 300 civila dödats och över 11 000 har gripits.