Ryska soldater i området som uppges ha en "fredsövervakande" funktion meddelar samtidigt att omkring 5 000 patroner överlämnats.
Tidigare under dagen uppgav separatister att azerbajdzjanska styrkor omringade Nagorno-Karabachs huvudort Stepanakert och paniken spred sig.
I Armenien har protester rasat mot att området lämnats i sticket.
– Läget i Stepanakert är fruktansvärt. Azerbajdzjanska styrkor finns överallt i utkanterna, sade Armine Hajrapetjan, talesperson för utbrytargrupperna i Nagorno-Karabach.
– Folk är rädda att soldater kan strömma in och börja döda när som helst.
Samtidigt är många i grannlandet Armenien upprörda över uteblivet stöd till Nagorno-Karabach, som har en armenisk-dominerad befolkning. För tredje dagen i rad blockerar demonstranter gator i huvudstaden Jerevan.
Armeniska upprorsmän i Nagorno-Karabach, som geografiskt ligger inne i Azerbajdzjan, lade i onsdags ned vapnen. Det skedde efter en blixtoffensiv från Azerbajdzjans militär.
Demonstranter och opposition i den armeniska huvudstaden Jerevan tycker att premiärminister Nikol Pasjinjan är för undergiven mot grannlandet Azerbajdzjan, och kräver starkare stöd för separatisterna i Nagorno-Karabach.
Områdets framtid är ännu oklar. Det senaste beskedet är att Armenien och Azerbajdzjan ska fortsätta förhandla.