Fälten, med en sammanlagd area på 255 hektar, ska ha varit gömda djupt inne i fem större skogar i delstaten Ondo i landets sydvästra delar.
Den narkotikabekämpande myndigheten NDLEA skriver att tretton personer har gripits och att man, bland annat, har tagit 250 kilo cannabisfrön i beslag.
På bilder och videoklipp som NDLEA har lagt upp i sociala medier syns hur myndighetspersoner sätter eld på stora cannabisplantor.
I Nigeria är det olagligt att odla och bruka cannabis.