Ett dussintal beväpnade män på motorcyklar ska ha utfört en koordinerad attack mot byarna, som ligger i delstaten Zamfara.
"Totalt 48 personer dödades av banditerna i de tre byarna som attackerades i fredags eftermiddag", säger Aminu Suleiman, administrativ chef i distriktet där byarna ligger, till nyhetsbyrån AFP.
Nordvästra och centrala Nigeria har i flera år plågats av kriminella gäng – som lokalt kallas banditer – rånar och attackerar hela byar och kidnappar folk för att få ut lösesummor.