Olyckan inträffade på söndagen i samband med att flera tågvagnar i provinsen al-Qalyubiyya norr om Kairo kolliderade.
Mer än 50 ambulanser körde i ilfart till olycksplatsen och skadade människor har förts till tre olika sjukhus i regionen.
Det fanns tidigt uppgifter i lokala medier om dödsoffer efter olyckan, men detta bekräftades inte förrän senare av de egyptiska myndigheterna.
Förra månaden miste minst 20 människor livet och nästan 200 skadades när två tåg kolliderade norr om staden Sohag i centrala Egypten.