Ovädret skapade stor förödelse i turistorten Cesme där träd slets upp, båtar sjönk och byggnader skadades.
– Inom loppet av bara 20 sekunder drabbades vi av denna stora olycka, säger Izmirs borgmästare Tunc Soyer.
– Många tak har blåsts av, fordon har lyfts upp och kastats i marken. Det är otroligt.
Av de 16 som förts till sjukhus skadades nio av den välta lyftkran, som föll över en byggarbetsplats i Cesmes grannort Alacati.
Tornador är ovanliga i Turkiet.
– Vi har också tänkt på dessa katastrofer som fenomen i fjärran östern eller Latinamerika. Men det är uppenbart att klimatförändringar innebär att dessa naturkatastrofer kommit allt närmre oss, säger Tunc Soyer.