Runt 30 personer har omkommit och tiotals har skadats. Enligt ministern befann sig över 1 000 människor på tåget vid tiden för olyckan.
Olyckan inträffade nära en järnvägsstation i staden Nawabshah i Sindh-provinsen. En anställd vid järnvägen uppger att totalt åtta vagnar spårat ur.
Enligt järnvägsministern kan det finnas två orsaker till det inträffade:
– Antingen var det ett mekaniskt fel, eller så var det medvetet – det kan ha varit ett sabotage, säger han.
Bilder som publicerats i pakistanska medier visar dussintals människor på platsen, där vissa krossar fönster för att hjälpa passagerare att klättra ut ur vagnarna.
Olyckor och urspårningar inträffar ofta på Pakistans föråldrade järnvägssystem, som transporterar fler än 80 miljoner passagerare per år.