Myndigheterna blockerade sajten efter att det nätbaserade uppslagsverket inte tagit bort innehåll som landet anser vara blasfemi, eller hädelse.
Telekommyndigheten PTA hade gett Wikipedia ett ultimatum som man menar att tjänsten inte levt upp till, och en talesperson meddelade att "de kommer att förbli blockerade tills de tar bort allt stötande material".
Men på måndagskvällen satte premiärminister Shehbaz Sharif ned foten och beordrade att blockeringen skulle tas bort och det omedelbart.
En av regeringen tillsatt kommitté hade då kommit fram till att censuren förde med sig "oavsiktliga negativa konsekvenser som är större än fördelarna".
Landet har tidigare tillfälligt stängt ner mediejättar som Facebook och Youtube.