Enligt FN:s beräkningar finns omkring 1,3 miljoner afghaner registrerade som flyktingar i Pakistan. Ytterligare omkring 880 000 personer har fått laglig status att stanna kvar i Pakistan.
Men enligt Pakistans tillförordnade inrikesministern Sarfraz Bugti befinner sig 1,7 miljoner afghaner illegalt i Pakistan och dessa måste lämna landet frivilligt eller bli deporterade.
– De illegala migranter och illegala utländska medborgare som befinner sig i Pakistan måste lämna senast 1 november, sade Bugti till reportrar i Islamabad på onsdagen.
Utspelet gjordes sedan Pakistan utsatts för flera dåd. Regeringen i Pakistan anklagar militanta grupper med baser i Afghanistan för att ha utfört attackerna.
Enligt Pakistan bär afghanska medborgare ansvaret för 14 av totalt 24 självmordsattacker som utförts i landet hittills i år.
Talibanregimen i Kabul reagerar skarpt på utspelet i Islamabad.
"Pakistans beteende mot afghanska flyktingar är oacceptabelt", skriver talibanstyrets talesperson Zabihullah Mujahid på X, tidigare Twitter.
Människorättsorganisationen Amnesty International vädjar till FN:s flyktingorgan UNHCR att påskynda en process för att granska asylrätten för de afghaner som flytt till Pakistan.
Omkring 600 000 afghaner har flytt till Pakistan sedan talibanerna tog makten i Afghanistan 2021 och införde inskränkande lagar och regler för invånarna.