Byggnader har satts i brand i städerna Paiam och Porgera under striderna, uppger polisen som har förstärkning av soldater i det oroliga området.
Två polisenheter "kontrollerar situationen i staden Porgera och har gått in i gruvan också", säger David Manning vid polisen.
Det är oklart om våldet kommer att påverka regeringens planer på att återuppta gruvdriften i området.