Av dem som skadats är 25 poliser.
Demonstrationen hölls en månad efter det att 18 demonstranter dödades på samma plats. Den här gången krävde demonstranterna rättvisa åt dödsoffren. Men när deltagarna återigen försökte inta flygplatsen uppstod sammandrabbningar med polisen.
Även i städerna Ayacucho och Pucallpa hölls demonstrationer. I huvudstaden Lima marscherade omkring 2 000 fackligt anslutna mot den tungt bevakade kongressbyggnaden under torsdagen, utan att några oroligheter inträffade.
Peru har skakats av två månaders protester från anhängare till den förre presidenten Pedro Castillo. De kräver att Castillos efterträdare Dina Boluarte avgår och att nyval hålls.