De greps på torsdagen, och anklagas nu för en rad brott varav medlemskap i en "terrorgrupp" och "spridande av falska nyheter" är ett par. De är i ett första skede häktade i 15 dagar, men det kan enligt lagen förlängas i upp till två år.
I ett uttalande tolkar FN:s människorättskontor (OHCHR) gripandena som "en mycket oroande utveckling" och skriver att de tycks vara en hämnd för att de tre anklagade arrangerade ett möte med utländska diplomater tidigare i november.
Det tyska utrikesdepartementet uttalar att det "tydligt fördömer eskaleringen mot det egyptiska civilsamhället" och kräver den "omedelbara frigivningen av dessa människorättsförsvarare".
Den egyptiska regimen och president Abd al-Fattah al-Sisi har gått hårdhänt fram mot både oppositionella och aktivister.