Oppositionen betraktade besluten som en kupp, och USA:s utrikesminister Antony Blinken uttryckte oro över utvecklingen.
De fem domarna, av domstolens 15 ledamöter, anses vara fientligt inställda till president Nayib Bukele. Bukeles parti Nya idéer (Nuevas ideas) har absolut majoritet i parlamentet efter att val i februari.
Beslutet att avsätta domarna grundades på att de fattat "godtyckliga" domar. Riksåklagaren Raúl Melara tvingades också bort av parlamentet.
Partiet är en tämligen ny spelare i landets politik, lett av den 39-årige Bukele som valdes till president 2019. Hans främsta vallöfte var att bekämpa organiserad brottslighet, och hans insatser har ofta mött på motstånd från den högsta domstolen och riksåklagaren. De traditionella ärkerivalerna, högerpartiet Arena och vänsterpartiet FMLN, enades i ett fördömande av besluten.