Aten har nu lämnat in en formell protest till Ankara efter onsdagens händelse.
Dendia var på väg hem efter ett officiellt besök men planet tvingades cirkla över Mosul i norra Irak i 20 minuter sedan turkiska luftfartsmyndigheter förvägrat det inträde.
Förutom protesten säger Greklands premiärminister Kyriakos Mitsotakis att han också ska informera andra EU-ledare om den "senaste turkiska provokationen".
Enligt utrikesdepartementet i Ankara fördröjdes flygplanet eftersom internationella regler om att rapportera in en resplan inte hade följts.
"Vår grekiska motpart blev också informerad om denna fråga", säger talespersonen Hami Aksoy enligt ett uttalande.