Enligt chefredaktör Marina Zolotova har hon och flera av de anställda på sajten Tut.by dessutom fått sina hem genomsökta av anställda kopplade till ett statligt organ för finansiella utredningar.
– Representanter från säkerhetstjänsten kom också till redaktionen, säger hon.
Enligt Belarus Journalistförbund frihetsberövades totalt 16 journalister under tisdagen.
Statskontrollkommitténs avdelning för finansiella utredningar, som ligger bakom tillslagen, är ett mäktigt organ som tidigare har slagit ner mot Belarus opposition. Myndigheten uppger att Tut.by är föremål för en utredning om misstänkt skatteflykt.
"Överlagd attack"
Regeringen drog tillbaka sajtens officiella mediestatus i höstas, när myndigheterna slog ner mot de omfattande protesterna mot den auktoritäre presidenten Aleksandr Lukasjenkos styre.
Medietillslaget har fått Belarus oppositionsledare Svetlana Tichanovskaja, som för närvarande befinner sig i exil i Litauen, att uppmana det internationella samfundet att visa sitt stöd till landets medier.
"Det här är en överlagd attack mot våra journalister och våra medier, och de behöver juridiskt skydd och skyndsamt flyttas till nya lokaler", skriver oppositionsledaren på Twitter.
Hungerstrejkar
Situationen för journalister i landet har försämrats kraftigt sedan protesterna inleddes i fjol.
Under föregående vecka dömdes två utländska journalister till 20 dagars fängelse vardera för sin rapportering om protesterna i landet. Båda journalisterna har nu inlett en hungerstrejk för att protestera över domarna.
Rättad: I en tidigare version angavs en felaktig tidslängd för två utländska journalisters fängelsestraff.