– Om de ber om välsignelser, varför inte? sade Franz-Josef Overbeck till journalister i Vatikanstaten efter en mottagning hos påven på fredagen.
Frågorna var föranledda av att över 100 katolska kyrkor runt om Tyskland förra månaden höll bröllopsceremonier för "alla dem som älskar varandra" oavsett sexuell läggning.
Det var en direkt utmaning mot Vatikanens linje. I mars upprepade den mäktiga Troskongregationen CDF, som försvarar kyrkans doktriner, att homosexualitet är en synd och att samkönade inte kan ges det äktenskapliga sakramentet.
– Vi är en själavårdande kyrka för alla medlemmar, även för homosexuella, säger Franz-Josef Overbeck som är en av vice ordförandena i Comece (katolska kyrkan i EU).
– Påven är en själavårdande påve. Han har sagt att vi ska göra det som tjänar folket, och då gör vi det.