Beslutet kommer genom ett presidentdekret som offentliggjordes på måndagen.
Den amerikanske medborgaren Edward Snowden har valt att leva i Ryssland sedan 2013, då han är eftersökt av amerikanska myndigheter för att ha läckt hemliga dokument.
2020 sade han att han skulle söka permanent uppehållstillstånd i Ryssland, men att han skulle behålla sitt amerikanska medborgarskap. Kremls talesperson Dmitrij Peskov säger att Snowden personligen har bett om ryskt medborgarskap för att underlätta för sin fru Lindsay Mills att åka mellan USA och Ryssland.
"Två års väntan"
I en kommentar till den ryska, statliga nyhetsbyrån Ria Novosti säger hans advokat Anatolij Kutjerena att även Mills ska söka medborgarskap.
"Min fru och jag har ingen önskan att vara separerade från våra söner. Efter två års väntan och nästan tio år i exil kommer lite stabilitet göra stor skillnad för min familj", skriver Snowden själv på Twitter.
Snowden och Mills har två söner, som båda är födda i Ryssland.
Anatolij Kutjerena säger att Snowden inte kommer att ingå bland dem som mobiliseras för att strida i Ukraina. Anledningen är att han inte har tidigare erfarenhet från ryska armén.
En av 75
Beskedet om president Putins beslut publicerades på en officiell regeringssida. Snowden är en av 75 utländska medborgare i Ryssland som får ryskt medborgarskap av president Putin.
Snowden läckte omfattande material om USA:s underrättelsetjänst National Security Agency (NSA) och information som den samlat in. Vita huset har inte kommenterat de nya uppgifterna, USA:s utrikesdepartementets talesperson Ned Price säger kort att han inte känner till att Snowdens "medborgarskapsstatus har ändrats".