President Vladimir Putins talesperson bekräftar att Tjubajs sagt upp sig.
– Han har lämnat sitt uppdrag på egen begäran, men om han har lämnat (Ryssland) eller inte är hans sak, sade talespersonen Dimitrij Peskov.
Tjubajs, som ses som en av arkitekterna bakom dåvarande presidenten Boris Jeltsins ekonomiska reformer och privatiseringsprogram på 1990-talet, blir därmed den hittills högste ryske företrädaren att bryta banden med Kreml sedan storkriget bröt ut för en månad sedan.
Den 16 mars flaggade president Putin för en kommande upprensning bland "avskum och förrädare", syftande på ryssar som kritiserar landets krigföring i Ukraina.