Den tidigare rekordet, 5 184 meter, uppmättes i juli 2022.
Att temperaturen stiger på allt högre höjder påverkar bland annat vegetationen, snögränsen och vattnets kretslopp, enligt den nationella vädertjänsten MeteoSwiss som utför mätningarna.
"Det har därför en avsevärd inverkan på livsmiljöerna för människor, djur och växter", skriver de i en kommentar.
Enligt MeteoSwiss registrerades det nya rekordet, som är den högsta höjden sedan mätningarna av nollgradersisotermen började 1954, natten mellan lördag och söndag.
Schweiz, liksom stora delar av Europa, upplever just nu en värmebölja där temperaturerna på många platser överstiger 30 grader.