Olyckan inträffade på fredagskvällen när en tankbil kolliderade med en lastbil på en bensinstation. Bränsle började läcka ut. Vittnen har berättat att människor strömmade till för att samla upp bränslet, skriver AP.
Plötsligt inträffade en kraftig explosion. Vad som orsakade den är oklart.
Minst 99 personer har omkommit och över 100 vårdas på sjukhus, uppger vice hälsominister Amara Jambai för Reuters.
Tillståndet är kritiskt för flera av de skadade.
Efter olyckan kallade sjukhusen in så många läkare och sjuksköterskor som möjligt.
Jättelika eldsflammor
I sociala medier sprids videoklipp från katastrofen. De visar jättelika eldsflammor som lyser upp natthimlen över Freetown, närliggande byggnader i brand och förkolnade kroppar.
"De filmer och bilder som cirkulerar på sociala medier är fruktansvärda", skriver Freetowns borgmästare Yvonne Aki-Sawyerr på Facebook.
På Twitter utlovar det västafrikanska landets president Julius Maada Bio stöd till de drabbade.
"Mina djupaste sympatier till familjerna som har förlorat anhöriga och de som har skadats", skriver presidenten.
Världshälsoorganisationen (WHO) kommer att sända förnödenheter och specialister på brännskador.
"Vi kommer att ge mer stöd om det behövs under den här fruktansvärda tiden för Sierra Leones folk", skriver WHO på Twitter.
Hittade sin lillebror
På lördagen var polis och militär på olycksplatsen för att mota bort människor som sökt sig dit. Många som kom sökte efter saknade släktingar, skriver AFP.
Osman Timbo berättar för AP att hans 13-årige bror Mohamed är ett av dödsoffren.
Brodern hade gått hemifrån för att köpa bröd. När Osman Timbo fick reda på vad som hänt gick han ner till olycksplatsen och hittade sin svårt brända lillebror.
– Jag mådde så dåligt, jag älskade honom så mycket, säger han.
Flera liknande olyckor har inträffat när människor försökt samla upp läckande bränsle från tankbilar.
Till exempel omkom omkring 100 personer sedan en tankbil exploderat i Tanzania 2019. Samma år dödades cirka 60 personer när en tankbil exploderade i Niger.