Enligt initiala uppskattningar har 22 människor dött och över 450 000 drabbats av översvämningarna, uppger FN:s organ för humanitär hjälp (Ocha) på söndagen.
Omkring 219 000 invånare i landet har fördrivits från sina hem, huvudsakligen i översvämningsutsatta områden, och förödelsen i vattenmassornas spår är stor.
Enligt FN:s lägesrapport har vatten bland annat strömmat in bostäder och på jordbruksmark, sköljt bort boskap, skadat vägar och tillfälligt tvingat skolor och vårdinrättningar att stänga.
Katastrofen kommer kort efter en rekordstor torka som förvärrat läget för miljontals somalier som står på randen av hungersnöd.