Spänningar i spåren av brexit ligger bakom attacken, rapporterar lokala medier.
Attacken skedde tidigt på måndag morgon. Männen beordrade föraren att lämna bussen innan de hällde bensin över den och tände på. Inga passagerare fanns ombord, uppger bussbolaget Translink.
Gärningsmännen nämnde Nordirland-protokollet, den del av Brexitavtalet som reglerar hur vissa varor som passerar mellan Nordirland och den brittiska huvudön ska kontrolleras, enligt Belfast Telegraph.
Många som vill ha kvar Nordirland som en del av Storbritannien anser att protokollet har skapat en gräns i Irländska sjön.