Giuffre har stämt Andrew i ett civilrättsligt åtal i USA. Hon anklagar prinsen för att ha våldtagit henne 2001, när hon var 17 år gammal och reste med den sexbrottsanklagade, numera avlidne, finansmannen Jeffrey Epstein.
Prins Andrew har tidigare försökt få fallet ogiltigförklarat, men domaren Lewis Kaplan i New York har godkänt att en rättegång kan genomföras.
Parterna har nått en överenskommelse utanför domstol, skriver Giuffres advokat David Boies i ett brev till domaren i New York. I brevet säger han sig tala för båda parter, men nämner ingenting om en ekonomisk uppgörelse.
I skriftväxlingen med domstolen uppges prins Andrew vilja donera "en omfattande summa till den målsägandes välgörenhetsorganisation".
Andrew uppges aldrig ha velat baktala Giuffre och han beklagar det hon fått utstå. Prinsen vill även ta avstånd från Epstein genom att "stötta kampen mot den ondskefulla sexhandeln och dess offer" genom att donera pengarna.
Uppgörelsen innebär att det civilrättsliga fallet inte kommer att tas upp inför domaren.
Prins Andrew har hela tiden nekat till anklagelserna. Inte heller i brevet till domstolen finns något erkännande om skuld.