Konflikten mellan den sudanesiska militären och den paramilitära gruppen RSF, som pågått sedan mitten av april, kan komma att destabilisera hela regionen, säger Gueterres via sin talesperson.
Generalsekreteraren fördömde samtidigt det storskaliga våldet i regionen Darfur, i västra Sudan – ett området som upplevt några av de värsta striderna i den pågående konflikten.
"Det pågående nonchalerandet av humanitära och mänskliga rättigheter är farligt och oroande," sade Guterres i uttalandet.
Han fördömde även den flygattack i huvudstaden Khartums systerstad Omdurman som krävde 22 människoliv. Attacken, som skedde under lördagen, beskrivs som en av de dödligaste sammandrabbningarna mellan militären och RSF.
Landets hälsominister uppger att över 3 000 människor har dödats i den senaste månadens stridigheter. Fler än 2,9 miljoner människor har flytt till säkrare områden i Sudan eller grannländer, enligt FN:s migrationsorgan IOM.