Grälet med höga militära insatser är det senaste i den storpolitiska kampen om Sydkinesiska havet.
Enligt Filippinerna upptäckte landets fiskare i förra veckan att Kina lagt ut en barriär vid ingången till revets grunda, fiskrika vatten.
På måndagsmorgonen meddelade filippinska myndigheter att "alla lämpliga åtgärder" skulle vidtas "för att undanröja barriären". Bara timmar senare lade kustbevakningen ut filmer och bilder som visar hur personal skär av barriärens rep och drar upp ankare.
"Barriären utgjorde en fara för sjöfart och var ett tydligt brott mot internationell rätt", skriver kustbevakningen.
Scarboroughrevet intogs av Kina 2012 och är en symboliskt viktig del av Sydkinesiska havet. Kina gör anspråk på i stort sett hela det havet, men även Brunei, Malaysia, Filippinerna, Taiwan och Vietnam anser att de har rätt till delar av de fiskrika och handelstäta farvattnen.