Anledningen är att ett tiotal av besättningsmännen har testat positivt för corona.
De omkring 300 sydkoreanerna kommer att flygas hem, uppger landets försvarsdepartement på söndagen.
I Sydkorea är smittoläget just nu allvarligt och i huvudstaden Seoul har nya restriktioner införts efter att Deltavarianten sprider sig. Drygt 30 procent av Sydkoreas befolkning har fått minst en dos covidvaccin.