I studien ska GBP510, som är landets första inhemska vaccinkandidat, jämföras med Astra Zenecas vaccin.
3 000 av de 3 990 vuxna som deltar i studien kommer att få vaccinet och 990 kommer att få Astra Zenecas vaccin, uppger biträdande hälsominister Kim Gang-Lip vid en presskonferens.
Över 200 000 människor har smittats av coronaviruset i Sydkorea och över 2 100 människor har avlidit med sjukdomen. Hittills har 15,4 procent av befolkningen vaccinerats.