Mbowe gjorde segertecken med fingrarna när han eskorterades in i domstolsbyggnaden i landets största stad Dar es-Salaam. Det var första gången oppositionsledaren setts till sedan han den 21 juli greps i sällskap med flera andra Chademapolitiker.
Mbowe anklagades vid gripandet för att "ha planerat terrorhandlingar, däribland en konspiration för att döda regeringsföreträdare". Chadema avfärdar anklagelserna som politiskt motiverade.
"Freeman Mbowe, parlamentariker sedan 15 år, ledare för oppositionen i parlamentet sedan tio år och ordförande för landets största oppositionsparti sedan 17 år, är inte en terrorist", skriver Chademas vice partiledare Tundu Lissu på Twitter.
"Han är en politisk fånge i Samias diktatur."
President Samia Suluhu Hassan tog över posten i mars sedan den hårdföre företrädaren John Magufuli avlidit, något som inledningsvis väckte hopp om en demokratisk utveckling i landet.
Den första rättegångsdagen blev kort. Domstolen valde att hänvisa målet till högre instans, som preliminärt ska ta upp målet den 13 augusti.