– Jag kan bekräfta att jag vidtagit åtgärder med följden att en anställd som arbetade åt främmande makt inte längre jobbar kvar på departementet, sade Lipavsky som inte ville ge några ytterligare kommentarer på grund av säkerhetsskäl.
Enligt lokala medier hade mannen högsta säkerhetstillstånd, samtidigt som han arbetat för den ryska underrättelsetjänsten SVR.
Mannen var anställd på tjeckiska UD sedan 1990-talet, och hade flera olika tjänster på bland annat ambassader. När han var i tjänst i Afrika rekryterades han av ett ryskt par, rapporterar den slovakiska tidningen Dennik N.
"De utnyttjade hans svaghet för kvinnor och pengar", citerar tidningen en diplomatkälla.
Tjeckiens underrättelsetjänst BIS nämner i sin årsrapport om utländsk aktivitet i landet återkommande Ryssland som ett av de största hoten.