"Dessvärre utan resultat", skriver danska Forsvarets Operationscenter på Twitter.
Tyskland, Sverige och Danmark samarbetade under dagen i den omfattande sökinsatsen.
Larmet kom från fraktfartyget på torsdagsförmiddagen. Flyg från Sverige och Tyskland samt två danska räddningshelikoptrar deltog i arbetet.
Sökandet omfattade ett stort område och även civila fartyg ombads hålla utkik.
Fartyget var på väg mot Riga i Lettland.