Olyckan inträffade vid 21-tiden på måndagskvällen, lokal tid, när ett fullsatt tunnelbanetåg krockade med ett tomt tåg som färdades i motsatt riktning.
Bilder som publicerats på sociala medier visar hur passagerare har kastats till golvet i en av vagnarna, som är täckt med glassplitter.
Av personerna i tåget ådrog sig 47 allvarliga skador och 166 lindriga skador.
Polisen tror att olyckan kan ha orsakats av bristande kommunikation. Premiärminister Muhyiddin Yassin säger i ett inlägg på Facebook att olyckan är allvarlig och att transportministern och operatören har fått i uppgift att genomföra en utredning för att hitta orsaken till den.