"Flygtjänsten har återupptagits", skriver flygplatsen på sin hemsida efter att tidigare stoppat alla starter och landningar på grund av hotet som mottagits via e-post.
"Det kan fortfarande bli flygförseningar", poängterar flygplatsen.
Hotet rapporteras ha framförts i ett mejl till Tysklands federala polis, och betraktades enligt en talesperson som skarpt. Det aktuella planet landade klockan 12.20 på måndagen. De 198 passagerarna och 16 medlemmarna i besättningen lämnade planet, som därefter söktes igenom av myndigheterna.
Hamburgs flygplats är Tysklands femte största.