"Män med vapen slår sönder min dörr. De säger att de är poliser men bär inte uniform. Jag har låst in mig själv", skriver Kakwenza i ett inlägg på Facebook.
Rukirabashaijas advokat säger till nyhetsbyrån Reuters att hans klient har frihetsberövats men att det är oklart var han hålls, av vem och av vilken anledning.
– Vi letar överallt efter honom just nu, säger han.
Rukirabashaija har skrivit flera böcker och är välkänd för "The Greedy Barbarian", en satirisk roman om ett fiktivt land som tar itu med teman som korruption och girighet.
I april 2020 fängslades Rukirabashaija av militären och förhördes i fem dagar om huruvida hans roman är en satir om Museveni som har styrt det östafrikanska landet i 35 år.
Rukirabashaija har korats som årets "International Writer of Courage" av Pen/Pinterpriset.