Branden bröt ut natten till onsdag i ett hotell som tjänade som flyktingboende i samhället Gross Strömkendorf i norra Tyskland.
14 personer som bodde där och tre anställda räddades från lågorna, enligt lokalpolisen. Ingen skadades.
Händelsen utreds som mordbrand. I måndags upptäcktes ett hakkors som klottrats på en entrédörr. Polisen vet ännu inte om det finns något samband mellan det nazistiska klottret och branden.
– En sak måste stå klart för alla: Folk som flyr krig behöver vårt skydd och stöd. Vi tolererar inte uppvigling eller våld, säger delstatens guvernör Manuela Schwesig.
En miljon ukrainska flyktingar, de allra flesta kvinnor och barn, har tagit sig till Tyskland sedan Ryssland inledde sin storinvasion i februari.