Staden ligger omkring fyra mil från Ukrainas gräns.

"Rysk luftvärnsutrustning upptäckte den ukrainska roboten och stoppade den i luften", lyder departementets uttalande.

Resterna av roboten ska ha fallit över Taganrog.

Samtidigt anklagar Ryssland Kiev för att genomfört "en terrorattack".

Åtminstone 15 personer uppges ha skadats i händelsen, enligt den regionala direktören.

"Räddningstjänsten är på plats. Det finns inga döda", skriver guvernör Vasilij Golubev på Telegram.

Även en annan robot ska ha skjutits ner i regionen, meddelar Moskva.