Centret är beläget i staden Kupiansk – några kilometer från den ryska gränsen – i Charkivregionen i nordöstra Ukraina.
Enligt den ukrainske presidenten rör det sig om en robotattack och det "rapporteras om döda och skadade".
Presidenten uppger även att en anläggning för den ukrainska flygkoncernen Motor Sich, som tillverkar flygplans- och helikoptermotorer, träffats av ryska missiler.
Natten präglades av ryska attacker på flera håll över landet och 30 kryssningsrobotar och 27 drönare sköts ned, skriver det ukrainska flygvapnet på Telegram:
"Totalt använde fienden 70 luftangreppsvapen i flera vågor natten mellan lördag och söndag".
Chmelnytskyj-regionen, där Ukraina har ett stort militär flygfält, ska ha varit ett av de områden som utsatts.
Ryssland bekräftar att man slagit till mot en flygbas i Chmelnytskyj-regionen. Landet hävdar också att man slagit till mot ytterligare en flygbas, i Rivne-regionen, och att "alla mål träffades".
Man påstår även att det ryska flygvapnet under söndagsmorgonen skjutit ner en drönare som flugit över Moskva:
"I dag vid 11-tiden försökte en drönare göra ett intrång mot Moskva. Den förstördes av luftförsvaret när den närmade sig", skriver Moskvas borgmästare Sergej Sobjanin på Telegram.