Ukrainas räddningstjänst skriver på meddelandetjänsten Telegram att även bostadshus och ett jordbruksföretag förstördes i anfallet.
Mykolajivs guvernör Vitalij Kim skrev tidigare på Telegram att roboten slagit ned i Stepove som är en liten by belägen omkring 45 kilometer nordväst om staden Mykolajiv.
Enligt Kim var ett av dödsoffren en kvinna.
"Räddningspersonalen drog fram henne ur den raserade byggnaden", skrev han.
Natten mot onsdagen dödades minst sex personer i ryska attacker mot Zaporizjzja och Dnipropetrovsk.