Summan de båda bolagen Trump Corporation och Trump Payroll Corp ska betala är 1,6 miljoner dollar (knappt 17 miljoner kronor).
Redan i december levererades fällande domar på de åtalspunkterna. Dessa rörde huruvida Trump Organization varit delaktigt i att undvika förmånsbeskattning för höga chefer som haft tillgång till hyresfria lägenheter och lyxbilar.
Att bötesbeloppet skulle bli förhållandevis lågt var också känt sedan tidigare – summan är ändå den högsta som domaren enligt lag kunde utfärda, skriver nyhetsbyrån AP.
Domen har också räknats som en framgång för de New York-åklagare som lagt ner tre år på att undersöka Donald Trump och hans affärer.
Trump, som i november i fjol meddelade att han ställer upp som presidentkandidat för Republikanerna, kallar utredningen av hans bolag en politiskt motiverad "häxjakt" som Demokraterna driver av hämndlystnad.